SimpleFold – 苹果开源的轻量级蛋白质折叠预测AI模型

SimpleFold是什么

SimpleFold 是苹果公司推出的轻量级蛋白质折叠预测 AI 模型。模型基于流匹配（Flow Matching）技术，跳过多序列比对（MSA）等复杂模块，直接从随机噪声生成蛋白质的三维结构，大幅降低计算成本。在 CAMEO22 和 CASP14 等权威基准测试中，SimpleFold 表现出色，无需昂贵的多序列比对和三角注意机制，能达到与顶尖模型（如 AlphaFold2、RoseTTAFold2）相当的性能，且小规模版本（如 SimpleFold-100M）同样具有高效性和竞争力。

SimpleFold的主要功能

• 高效预测蛋白质三维结构：从氨基酸序列快速生成蛋白质的三维结构。